当纳祖虫巢意志的化身——主列带领着虫海征向星盟和人类，并全面入侵人类星区。电视广播频道播放着虫族入侵人类星区，一时间人心惶惶，大街小巷都在讨论人类的未来。在W2星系，这一人类殖民的第二个星系。一颗名为理想星的繁荣行星上也在播放着虫族入侵，然而，虫族入侵阿波罗星系失败后，转而，入侵星盟的天刀星系。星盟军队正与虫族激烈对抗，在理想星，一所名为电华城的城市。一个低着头，满脸忧愁，神色紧绷，戴着眼镜，手提公文包的先生走在街上，这天，街上下着大雨。这位先生名为格考尔斯.福洛，福洛是一位学者，福洛研发新型互联网技术，本来与富商朋友达利克.兰斯一起将这项技术发扬光大，可是，兰斯霸占了技术成果，并对外宣称是自己的成果，福洛看着自己的成果被他人窃取，非常心寒，并离开兰斯的雄鹰科技，在一所学校任职信息教授。福洛整日饮酒，整日浸泡在网吧。日益颓废，一天晚上，福洛在看手机新闻，看到了虫族入侵到新闻。福洛并不关心，福洛只想浑浑噩噩的度过一生。直到看到新闻中对虫族骸骨的研究让福洛来了兴趣，他暂停视频。观察着骸骨，他盯着骸骨上的黑斑，他越看越不对。他觉得有一种东西寄生在虫族，福洛将他的发现以说明稿的方式邮件给生物研究所。研究所的人只是看了几眼，便丢在一旁。
于此同时，天刀星系上的星盟军队节节败退，俩艘航母耀光被巢虫领主扎克莫尔腐蚀为绣铁繁殖虫族战士。艾瑞尔人军队伤亡惨重，高阶执政官索尼赫鲁斯乘坐在一艘名为“亚波神光”的方舟上，看着艾瑞尔战士退缩防线。身披金色战铠的艾瑞尔人意志逐渐萎靡，战场上，激光战矛插满地面。扎克莫尔用灵能向星盟军队说到：“哈哈，比人类还弱，这就是所谓的星盟，哈哈。”索尼赫鲁斯握紧拳头，命令方舟上的所有赤鹰战斗机群冲向扎克莫尔。很快，战斗机群被俩边的四翼飞龙群吞噬。空中激战就此爆发，飞龙掠过方舟，离子炮不断轰击着虫海。虫海好像是无穷无尽的，很快，索尼赫鲁斯伤亡越来越多。然后，虫海依旧一波一波扑向星盟战士们。正当扎克莫尔认为胜利之时，从方舟冲出一台有索尼赫鲁斯驾驶的泰坦级机甲正耸立于太空，这台名为“霸天阿修罗”的机甲，散发着强大的力量，霸天阿修罗背上的金光四翼绽开，向四周发射离子光弹，消灭了这支飞龙群。霸天阿修罗拿起背上的狙击炮，瞄准好，一发聚能离子光弹在虫海炸开。扎克莫尔挥舞俩枚巨齿砍向霸天阿修罗，巨齿重重的砸中机甲的肩膀。霸天阿修罗举起巨齿，重重的一拳击中扎克莫尔的复眼，并抓住脖子，扯下了扎克莫尔的口器。于此同时，扎克莫尔背部的利刺扎穿机甲。索尼赫鲁斯动用自身灵能，机甲内部的核心不断转动。机甲的手臂一起抓住其中一只巨齿，并将其扯下，扎克莫尔痛苦嘶吼，将腐蚀液体溅射在霸天阿修罗。霸天阿修罗将狙击炮插入扎克莫尔的胸口，随着一声爆炸。霸天阿修罗迅速飞出爆炸。但是，爆炸过后，却是在一枚虫卵漂浮在空中，随着虫卵破裂，一只蜥蜴人形怪物从虫卵跳出，这只蜥蜴人形怪物拥有数对獠牙和一对硕长的犄角。怪物正是扎克莫尔，扎克莫尔跳到霸天阿修罗背上，并发出诋语：虫族的进化能力岂是你们能够了解的。说完，扎克莫尔撕扯着霸天阿修罗的滑翔翼。霸天阿修罗抓住扎克莫尔，将其拽下，可进化后，拥有敏婕反应了的扎克莫尔一拳打穿霸天阿修罗的腹部。这时，索尼赫鲁斯感到疼痛，原来，驾驶舱中的头盔所连接的十几根管道与驾驶员的神经系统互通，机甲受到伤害，驾驶员也会受到伤害，这些管道放大了脑波，使其，让驾驶员在精神领域产生灵能。所以，能够成为泰坦级机甲的驾驶员都是拥有强大意志的角色。
霸天阿修罗推开扎克莫尔，并抱紧扎克莫尔，命令“亚波神光”发射离子脉冲毁灭令，副指挥卡格鲁斯并不想按照索尼赫鲁斯的要求，让他与扎克莫尔同归于尽。但是，索尼赫鲁斯一再要求。最后，卡格鲁斯辈愤的按下屏幕。随着方舟蓄能，扎克莫尔察觉到索尼赫鲁斯的行动，立刻，命令虫海支援。大量飞龙和虫巢舰飞向方舟，为了为方舟蓄能争取时间，艾瑞尔战士义无反顾，向虫海厮杀。随着蓄能完毕，一道能量巨大的光线射向霸天阿修罗和扎克莫尔。随着又一声巨大的爆炸，卡格鲁斯愤怒吼道：“不能辜负高阶领主的牺牲！全体战士向前冲，为了星盟的荣耀，无上光荣！”就这样，随着巢虫领主扎克莫尔的牺牲。扎克莫尔所控制的虫海自相残杀且混乱不堪，星盟战士很快击败了虫海。
星盟在这场战役中付出了惨痛的代价，星盟意识到，想要打败虫族这个强大的敌人，就必须与人类联手一起对付虫族。星盟最高委员会派出佐顿星人塞亚乌蒙驾驶着星震号与人类谈判，在人类地球同盟TOE因为虫族入侵而头疼，并召开中央议会，进行交流。巴滋克.哈士多认为应该加大军备进行虫族大清扫，其他领导人——叶凯、阿汉季.兰斯、布克.麦尔逊纷纷赞同巴滋卡的清扫计划，当到达投票阶段时，一位身披暗耀铠甲的佐顿星人来到了会堂。通过吼间的翻译器，这位高傲的星盟佐顿星人塞亚乌蒙说到：“虫族的强大，想必各位有目共睹，愚蠢的人类还妄想消灭虫族，呵呵，真是可笑。”一时间，会堂被突然闯进的外星人打断了安静的氛围。秘书长金恩权下令守卫捉拿闯入会堂的佐顿星人，守卫举起枪后，塞亚乌蒙说到：“星盟不是来打架的，是和你们一起对付这该死的虫子。”巴滋卡下令守卫放下冲锋枪，并站起来说到：“想必你们星盟也遭到了虫族的入侵，是吧”塞亚乌蒙说到：“没想到你们人类也是清楚的。”巴滋卡嘴角露出笑容并说到：“说吧，星盟想要什么。”塞亚乌蒙说到：“我们星盟人员通过研究发现虫族的各个个体是根据一位强大的巢虫领主指挥而成，一旦巢虫领主死亡，该个体虫族就会混乱，这是虫族的弱点。”塞亚乌蒙继续说到：“虫族背后其实还有一个更强大的首领，我们希望你们人类与我们联手，共同消灭这个目前最大的敌人，也就是主列。”巴滋卡说到：“这些消息确认属实。”塞亚乌蒙气愤的说到：“我们牺牲了一位优秀的高阶领主才获得的消息，别让星盟失望。”巴滋卡从塞亚乌蒙这俩双，坚定的外心灵眼看出痛恨。巴滋卡走向塞亚乌蒙，一旁的金恩权试图阻拦，巴滋卡举手示意金恩权退下。与塞亚乌蒙近距离接触，塞亚乌蒙说道：“你难道不惧怕我吗？”巴滋卡伸出右手说到：“你们外星人喜欢握手吗？”这一行为真诚的感动了这位佐顿星人星盟高级议会皆将军。塞亚乌蒙说到：“好的，朋友握手。”一只粗壮的外星手臂与人类的手臂贴在了一起。
这场终结母巢主列的大战正式打响了，于此同时，主列感应到了在遥远的W2星系有一种可怕的力量。并带领所有虫族前去人类W2星系，终日酗酒的福洛在得知生物研究所并未理睬福洛，并将一封冷嘲热讽的电子邮件发送在福洛的设计账号。福洛感到绝望，并躺在床上，陷入梦乡。在福洛的梦境：一场毁灭降临在理想星上，福洛，站在废墟上，看着远处的战火和逃离中的人们，突然，一股圣光从天而降。正当，福洛用右手遮挡光芒，想透过刺眼的光芒看清楚散发光芒的是什么东西时，福洛被一旁的电话惊醒。福洛打开智脑电话，说到：“哪位？”是我，福洛听到声音，非常气愤，“有什么事吗？达利克。”每次，电话另一头正是达利克.兰斯。兰斯说到：“朋友，我要结婚了，你能来吗？”福洛不耐烦的说到：“我很忙，抱歉。”兰斯说到：“好吧。”几天后，福洛依然和往常一样，从学校走回家。但是，脑海中却是那场梦种的圣光。一支庞大的人类远征军来到了W2星系，星系总督陈布雷亲自接远征军总指挥，没错，就是恩布铁克.凯撒，很快，星系新闻就播放了远征军降临W2星系的新闻。凯撒在新闻中讲到：“这次我们预测了虫族大军会降临这个星系，我们会和星盟盟友，共同联手度过这次危机。”福洛看到了新闻，想将自己对虫族研究的成果交给凯撒。福洛在得知凯撒会在理想星进行阅兵仪式，并打算在阅兵仪式将自己对虫族骸骨上发现的黑色物质报告亲自交于凯撒手中。果然，阅兵仪式当天，凯撒在理想星首都梦想城亲自带着礼兵走在繁华的街道，周围都是记者拍照。福洛伪装成记者，并冲进阅兵方阵。周围的人被这一极端的行为吸引了注意，纷纷辱骂福洛。福洛在大庭广众之下，张开手中的研究报告，告诉大家虫族其实被一种可怕的物质控制着。一位民众却说到：“那又怎样，远征军会消灭这些怪物。”福洛继续说到：“这些物质不是物理宇宙的东西，非常危险，类似一种魔法。”只见周围越来越多的人指责福洛，凯撒也命令卫兵将福洛轰走。就这样，福洛被轰出了街道。福洛心痛于人们的无知与野蛮，并垂头丧气的回到家中，这时，他从家中看到了一封邮件。他翻开邮件，正是达利克的邮件。达利克在邮件说到：“很抱歉，兄弟你一直在误会我，其实，当初，你的互联网科技存在漏洞，我怕刺激到你的自尊心，暗自修改了系统，但是，你迟早会知道的，我想让你知道这项技术在你心中是完美的，就霸占了成果，隐藏了真相，没想到你活得如此悲惨，我在新闻上看到了你擅闯阅兵仪式，兄弟，这一次我必须帮助你，邮件底下有一枚我耗费了巨大的人力财力研究出来的智能芯片，结合了你的互联网技术，这枚芯片的名字叫做麒麟。我想，只有你能知道怎么运用它。”这一刻，福洛陷入了沉思，他，后悔没有去参加达利克的婚礼。这时，脑海在次浮现出了那股圣光。他看清楚了是什么散发着圣光——曦枫.神光创世。福洛清楚的知道，想要打败，眼前这个敌人，也就是虫族。还需要一股强大的外力，与虫族背后外力相当的外力。一不做，二不休。福洛摘掉眼睛，来到了雄鹰科技，并希望达利克用公司资源打造一台泰坦级机甲。达利克表示反对，达利克说到：“这是你过了那么久后，第一次来找我，我很感动，但是，机甲它是官方的产物，是军用物品，民间生产机甲只会是违规。”福洛说到：“兄弟，我知道，帮我一把，求你了。”达利克喝下一杯葡萄酒便说到：“好吧，兄弟，这是我欠你的。”福洛，将机甲蓝图亲自交给了达里克。达利克接过蓝图，并命令手下及其团队，立刻打造机甲。
这是，在W2星系空中，产生了一个巨大的黑洞，黑洞中冲出的是虫海。以及一个巨大的空中怪物——主列，主列的形状偏向一个拱圆。长满了蛆虫和触须，以及许多复眼。凯撒带领着远征军炮击着眼前的敌人，孢子虫群空投至临近的星球上。开始腐化着行星，地面防卫军面对虫群严阵以待。蚁虫以庞大数量侵蚀着人类建筑，巨大的武士虫撕裂着周围。冲锋枪的扫射和坦克的炮击清扫着眼前的虫群，但是，虫群好像无穷无尽，人类的防线也逐渐破碎。这是，主列释放强大的灵能波动。只见远处的一片人类军队直接爆炸，凯撒被这一强大的力量震惊到。这时，星盟的远征军——由大灵能者神圣卡拉尔带领，卡拉尔通过灵能感觉到了主列，并在精神领域与主列对话，主列说到：“愚蠢的生物，你们无法阻止强大的死星。”当巢虫领主海翁伯克命令虫海按照计划吞噬时，一支隐形的部队在海翁伯克身旁，这支由克卡修斯.马克指挥的人类幽灵军，专门为了刺杀巢虫领主。幽灵军锁定巢虫领主的的要害——软脑组织，并以一发消音聚变弹炸穿了巢虫领主海翁伯克，导致当场死亡。果然，一支虫海陷入了混乱。主列感觉到了海翁伯克的死亡，神圣卡拉尔说到：“我已经知道你们这些怪物的秘密了。”这时，主列直接控制所有虫海，废除了巢虫领主的间接控制地位。主列想知道自己的主人饕餮想要什么东西，在克尔行星和多比行星沦陷后，新盟与人类开始节节败退。士气开始低落：虫子太多了，根本杀不完。卡拉尔乘坐的玛多号航母移动向主列，原来，卡拉尔，身为新盟灵能最强者，想利用玛多号巨大的能量与主列同归于尽。并在能量爆炸后，亲自驾驶着泰坦级机甲圣赫巴斯与主列内部那个虫族原体进行决战。果然，越是靠近主列，虫群的数量就越多，甚至，，还有精英虫群。比如，远古守卫和锈铁飞龙这俩种空中虫族精锐。但是，玛多号周围的护卫舰，以及做顿战士和艾瑞尔战士进行一轮一轮的防守。凯撒在得知星盟的计划后，感叹道：“怪不得，星盟能够如此强大，原来，英雄辈出。”果然，主列被玛多号的强大能量炸开。卡拉尔驾驶着圣赫巴斯进入主列内部，内部如同迷宫一般。卡拉尔凭借自己强大的灵能找到了母巢，卡拉尔拿起圣剑正要劈砍下去，一旁便生成了一个强大的怪物。这个蜥蜴人形怪物拥有三只尾巴，脸上只有一只圆形眼睛，数对獠牙和尖嘴，背上有三对尾刺，看起来，非常恐怖。怪物打向圣赫巴斯，怪物发出尖锐的嘶吼，圣赫巴斯将圣剑直入怪物，怪物一拳击开圣剑。圣赫巴斯并不想与怪物周旋，他想摧毁母巢。怪物通过灵能与卡拉尔交流：“哈哈，我与母巢是一体的，母巢会为我提供无穷的能量，记住，我是魔神安拉路尔。”这时，安拉路尔释放一股强大的冲击波将圣赫巴斯击退。接着，用尾刺扎穿机甲。卡拉尔陷入被动。
突然，一台泰坦级机甲迅速飞入太空，引起所有人的注意。这是由福洛驾驶的机甲——曦枫.神光创世，曦枫挥舞着手中的动力光刀飞进主列内部。凯撒在看到陌生机甲后，异常气愤，命令达伦克.威奇驾驶着冰冷死神消灭这台来历不明的机甲。当，圣赫巴斯受损严重时，曦枫从头而降，将散发着神力光芒的光刀直插安拉路尔腹部。安拉路尔以及死星感受到了一股与宇宙黑暗对立的圣洁之力曦枫拔出光刀，一阵能量波打向安拉路尔，安拉路尔魂飞魄散。正当，福洛打算击毁母巢之时，圣赫巴斯说到：“人类，将这个使命交给我吧，唯有我的灵能才能彻底摧毁母巢。”福洛转身离开，将一切交给了神圣卡拉尔。只见卡拉尔引爆胸口的强大灵能。一股超越超新星爆炸的巨大能量摧毁了母巢，神圣卡拉尔也因此死去。这场浩劫被终结了，失去母巢的虫族，如同一盘散沙，星盟与人类摧枯拉朽的将虫族击败。战争胜利了，但是，威奇驾驶着冰冷死神跟丢了。在这个银河，没有绝对的朋友，很快，星盟和人类将再次对立。虫族四分五裂，不同的巢虫领主控制着不同的虫群部落。日后，也将是威胁人类与星盟的势力。至于，福洛究竟获得了什么样的力量，那是远古神力，福洛即是天选之人，但，并不是唯一，很快，莱德塔斯人类帝国的阿布克多大远征会重创人类地球同盟TOE，第二次星际大战也将在不久后爆发，一个新兴人类帝国政权又将诞生——炎黄